Diagnostic moléculaire et recherche des gènes de résistance des souches de la tuberculose isolées dans la région de l’Ouest Algérien

Abstract

Résumé (Français et/ou Anglais) : La tuberculose multirésistante (TB-MDR) est définie par la perte de sensibilité des souches du complexe Mycobacterium tuberculosis aux deux majeurs antituberculeux: l’isoniazide (H) et la rifampicine (R).L’objectif de notre étude était de décrire le profil épidémiologique, clinique, bactériologique, et évolutif des tuberculeux multirésistants dans la région de l’Ouest Algérien. Trente- six patients étaient colligés. L’âge moyen était de 33,7 ans. Les facteurs de risque de TB-MDR soulignés dans notre série étaient : le tabac (n=12 ; 33,3%), l’alcoolisme (n = 1 ; 2,8%), les antécédents familiaux de TB-MDR (n = 3 ; 8,33%), le diabète (n =1) et HIV=1 équivaut à 2,8% pour chacun. La TB-MDR primaire a été retrouvée dans 11,11 %des cas, tandis que la secondaire dans 88,89% des cas. Il s’agissait d’une résistance à l’H et R dans 13,8 % des cas (n=5) ; à l’H, R et streptomycine (S) dans 50 % des cas (n=18) ; à l’H, R et éthambutol (E) dans 5,6 % des cas (n=2). Le pourcentage des patients qui avaient perdu la sensibilité du bacille aux quatre antituberculeux de première ligne (H, R, S et E) était de 25 % de l’ensemble des malades testés (n=9) et l’H, R, S, et ofloxacine (O) dans 2,8 % des cas (n=1). Un patient présentait une TB ultra-résistante (XDR) soit 2,8 %. La guérison a été déclarée dans 10 cas, 5 malades étaient décédés, 17 étaient en cours de traitement et une abondance de traitement a été notée pour 4 cas. L’émergence des souches multirésistantes de la tuberculose est l'une des préoccupations majeures de la politique de la santé et le diagnostic rapide ainsi que la détection de la résistance à la rifampicine chez les patients infectés sont essentiels pour la gestion de la maladie. De ce fait, les échantillons d'expectorations de patients forts suspects de tuberculose multirésistante ont été soumis à examen microscopique de frottis, la culture, les méthodes classiques de détection de résistance suivie par test GeneXpert MTB / RIF. Sur un total de 50 cas inclus dans cette étude, MTB a été détectée chez tous les patients (100%) par GeneXpert MTB / RIF. Cependant, la résistance du RIF a été détecté dans seulement 21 cas (42%) par GeneXpert MTB / RIF. Toutes les souches résistantes à la rifampicine détectées par GeneXpert MTB / RIF ont été confirmées comme phénotypiquement souches multirésistantes. 42,85 % des cas étaient des cas d'échec de retraitement, les cas de retraitement frottis positif à 4 mois étaient 23,82 %. Alors que 19,05% des cas étaient des cas de retraitement frottis positif au moment du diagnostic, et 14,28% des patients avaient des antécédents de contact avec la TB-MDR. La sensibilité, la spécificité, la valeur prédictive positive et la valeur prédictive négative de Xpert MTB / RIF pour détecter la résistance RIF par rapport à la technique classique de sensibilité phénotypique de la drogue ont été trouvés égaux aux taux de 100, 100, 100 et 100 %, respectivement. Le taux de résistance primaire trouvé dans cette étude constitue une menace pour les efforts de contrôle de la tuberculose MDR en Algérie, Il est donc important d’actualiser les résultats et d’évaluer l’ampleur du problème. GeneXpert MTB / RIF test est une technique efficace et fiable pour le diagnostic rapide de la tuberculose.

Multidrug-resistant TB (MDR-TB) is defined as the loss of sensitivity of strains of Mycobacterium tuberculosis complex to the two major tuberculosis drugs: isoniazid (H) and rifampicin (R). The aim of our study was to describe the epidemiological, clinical, bacteriological profile, and progressive multi- resistant tuberculosis in the western region of Algeria. Thirty- six patients were collected. The medium age was 33.7 years. MDR-TB risk factors outlined in our series were: smoking (n = 12; 33.3%) , alcoholism (n = 1 , 2.8 %) , family history of MDR-TB (n = 3; 8.33% ) , diabetes ( n = 1) and HIV = 1 is equivalent to 2.8% for each. Primary MDR-TB was found in 11.11% of cases, while second in 88.89 % of cases. This was a resistance to H and R in 13.8% of cases (n = 5); to H, R and streptomycin (S) in 50% of cases (n = 18); to H, R, and ethambutol (E) in 5.6% of cases (n = 2). The percentage of patients who lost the bacillus sensitivity to four first line TB drugs (H, R, S and E) was 25% of all patients tested ( n = 9) and H , R, S , and ofloxacin (O) in 2.8% of cases (n = 1). One patient had an ultra- resistant TB (XDR) or 2.8%. Healing was reported in 10 cases, 5 patients had died, 17 were being processed and an abundance of treatment was noted in 4 cases. The emergence of multidrug-resistant strains of TB is a major concern of the health policy and the rapid diagnosis and detection of rifampicin resistance in infected patients is essential for managing the disease. Therefore, samples of sputum strong MDR-TB patients suspects were subjected to smear microscopy, culture, traditional methods of resistance detection test followed by GeneXpert MTB / RIF. Of a total of 50 cases included in the study, MTB was detected in all patients (100%) by GeneXpert MTB / RIF. However, RIF resistance was detected in only 21 cases (42%) by GeneXpert MTB / RIF. All strains resistant to rifampicin detected by GeneXpert MTB / RIF have been confirmed phenotypically as multidrug resistant strains. 42.85 % were cases of retreatment failure cases of retreatment smear positive 4 months was 23.82%. While 19.05% of the cases were smear positive retreatment at diagnosis, and 14.28% of patients had a history of contact with MDR-TB. The sensitivity, specificity, positive predictive value and negative predictive value of Xpert MTB / RIF for detecting RIF resistance compared with the conventional technique of phenotypic susceptibility of the drug were found equal to the rate of 100, 100, 100 and 100%, respectively. The primary resistance rates found in this study is a threat to the MDR TB control efforts in Algeria, it is important to update the results and assess the extent of the problem. GeneXpert MTB / RIF test is an efficient and reliable technique for rapid diagnosis of tuberculosis.